В работе показано, что организация инновационных технологических проектов в региональных инновационных системах с догоняющим типом экономики опирается на развитие кооперации субъектов инновационной деятельности. Развитие технологического предпринимательства невозможно без планомерного и системного процесса регионализации экосистемы инновационного бизнеса в стране. Обосновывается основа развития экосистемы инновационного предпринимательства в экономике догоняющего типа. Показано, что механизмом реализации инновационных процессов в инновационных проектах может стать Региональный центр инкубации и акселерации и многофункциональный государственный Единый региональный инвестиционный фонд.